海洋样品中放线菌菌株的分离及其抗生素生物合成基因簇的挖掘

海洋样品中放线菌菌株的分离及其抗生素生物合成基因簇的挖掘近些年来,由于抗生素的滥用,导致病原微生物对药物产生耐药性的速度要远远快于新型药物发现的速度。这就要求我们必须采用其他有效的方法来获得新型抗生素

海洋样品中放线菌菌株的分离及其抗生素生物合成基因簇的挖 掘 近些年来,由于抗生素的滥用,导致病原微生物对药物产生耐药性的速度要 远远快于新型药物发现的速度。这就要求我们必须采用其他有效的方法来获得新 型抗生素。 随着陆生放线菌研究的日益完善,现在从陆生放线菌中发现新型次级代谢产 物应用于新药开发的几率越来越小,而海洋中的微生物由于不同于陆生的环境, 会产生一些不同的次级代谢产物。因此,自上世纪八十年代,人们开始重视海洋放 线菌资源的开发。 随着测序技术的迅猛发展,自2002年天蓝色链霉菌的基因组序列被测定之 后,越来越多的链霉菌基因组测序完成。分析这些基因组信息,我们发现大多数链 霉菌都含有几十个与代谢产物有关的基因簇。 但是目前却只找到了很少量的基因簇相对应的化合物,如果能够使这些沉默 的基因簇得到表达,那么将能够产生大量有活性的化合物。基于上述几点,我们将 研究的重点放在了海洋放线菌上,将从海洋泥样中获得的链霉菌在异源表达宿主 天蓝色链霉菌M1152中进行异源表达,期望能够筛选到有活性的化合物。 本实验针对从北极、南极、南海获得的50份泥样进行了放线菌的分离,共获 得了七株放线菌。对已分离获得的放线菌,进行了16SrDNA测序确定了它们的分 类地位,其中三株分离菌为诺卡氏菌,四株为链霉菌。 选取了实验室常用的培养基用来对各菌株进行培养,检测其最适的产孢培养 基。另选用了实验室常见的生测指示菌检测了这几株海洋放线菌的生物活性,从 其中挑选出抗菌谱广且抗菌活性高的42#菌株作为研究对象,构建其cosmid文