基于新一代测序的数字基因表达谱生物信息学分析平台的建立及应用的综述报告

基于新一代测序的数字基因表达谱生物信息学分析平台的建立及应用的综述报告随着科技的进步和生物学研究的深入，越来越多的生物信息学技术被应用到基因表达谱的研究中。新一代测序技术在生物信息学研究中发挥了巨大的

基于新一代测序的数字基因表达谱生物信息学分析平 台的建立及应用的综述报告 随着科技的进步和生物学研究的深入，越来越多的生物信息学技术 被应用到基因表达谱的研究中。新一代测序技术在生物信息学研究中发 挥了巨大的作用，因为它可以更深入地研究RNA表达水平和转录组学。 本文将对数字基因表达谱的生物信息学分析平台的建立及应用进行综 述。 数字基因表达谱生物信息学分析平台的建立 数字基因表达谱生物信息学分析平台是一个完整的生物信息学工具 包，它可以用于新一代测序的数据分析和功能注释。该平台通常由RNA 样本准备、RNA测序、序列质控、转录组拼装、差异表达分析、功能注 释、网络构建和通路分析等步骤组成。主要包括以下几个方面： 第一，RNA样本准备。RNA样本准备通常包括RNA提取、RNA 纯化、RNA浓度确定、RNA质量检测和RNA样本处理等。 第二，RNA测序。RNA测序是数字基因表达谱的重要组成部分， 通常采用IlluminaHiSeq2500或IlluminaHiSeq4000等新一代测序 仪器进行测序。该步骤的主要目的是将采集到的RNA转录本转换为 cDNA文库，并进行高通量测序。 第三，序列质控。序列质控是数字基因表达谱的必要步骤，它可以 帮助对数据进行筛选和质控。主要包括read质量和length的检查，去 除氨基酸序列、低质量序列和接头序列等。 第四，转录组拼装。转录组拼装主要是将测序得到的reads通过软 件进行拼装和分析，得到全长转录本和scaffold的基因组坐标。