生物信息学期末考试重点

生物信息学期末考试重点数据库（Database）是按照 数据结构来组织、 存储和管理数据的仓库；它产生于距今六十多年前；随着 信息技术和市场的发展；特别是二十世纪九十年代以后； 数据管

1、 生物信息学期末考试重点 2、 数据库（Database）是按照来组织、和管理数据的仓库；它产 数据结构存储 生于距今六十多年前；随着和市场的发展；特别是二十世纪九十年代 信息技术 以后；不再仅仅是存储和管理数据；而转变成用户所需要的各种数据 数据管理 管理的方式。数据库有很多种；从最简单的存储有各种数据的到能 类型表格 够进行海量的大型都在各个方面得到了广泛的应用。 数据存储数据库系统 3、 表达序列标签 从一个随机选择的cDNA 克隆进行5’端和3’端单一次测序获得的 短的cDNA 部分序列；代表一个完整基因的一小部分；在数据库中其长度一般从 20 到7000bp 不等；平均长度为360 ±120bp。EST 来源于一定环境下一个组织 总mRNA 所构建的cDNA 文库；因此EST也能说明该组织中各基因的表达水平。 4、 开放阅读框 是序列中的一段无终止序列打断的序列；可编码相应的 基因碱基 。ORF识别包括检测六个阅读框架并决定哪一个包含以和 蛋白启动子终止子 为界限的DNA序列而其内部不包含启动子或终止子；符合这些条件的序列有可能 对应一个真正的单一的基因产物。ORF的识别是证明一个新的DNA序列为特定的 蛋白质编码基因的部分或全部的先决条件。 5、 蛋白质的一级结构 在每种蛋白质中按照一定的数目和组成进行排列；并 氨基酸 进一步折叠成特定的前者我们称为蛋白质的一级结构；也叫初级结构 空间结构 或基本结构。蛋白质一级结构是理解、作用机制以及与其同源 蛋白质结构蛋 的必要基础。 白质生理功能 6、 基因识别 是生物信息学的一个重要分支；使用生物学实验或计算机等手段识别 DNA序列上的具有生物学特征的片段。基因识别的对象主要是蛋白质编码基因； 也包括其他具有一定生物学功能的因子；如RNA基因和调控因子。基因识别是基 因组研究的基础。 7、 单核苷酸多态 指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态 性。这种变异可由单个碱基的转换(transition)或颠换(transversion)所引起；也可由 碱基的插入或缺失所致；它是人类可遗传的变异中最常见的一种。占所有已知多态 性的90%以上。 1/ 7