微卫星位点筛选方法综述

论文综述微卫星分子标记筛选方法综述摘要：微卫星是一种短的串联重复序列(short tandem repeat, STR)或简单重复序列 (simple sequence repeats, SSR)0它

论文综述 微卫星分子标记筛选方法综述 摘要：微卫星是一种短的串联重复序列或简单重复序列 (short tandem repeat, STR) 它作为一种重要的分子遗传标记，能较好地反映 物种的 (simple sequence repeats, SSR) 0 遗传结构和遗传多样性变化，被广泛应用于实验动物的研究。本文概述了 获得和富集微 卫星位点的常用方法。最简便、最省时的方法是从从公共数据库(如 、、 GenbankEMBL 数据库等)或已发表的文献中查找到微卫星位点，但只 限于已经有序列数据发布的 EST 物种；第二种方法是种间转移扩增，即从相近物种的 数据库中查找微卫星位点，或使用 已有数据发表的遗传距离相近物种的微卫星标 记。第三种方法是从基因组中筛选 DNA 微卫星位点，其中用于富集微卫星的方 法有引物法、磁珠杂交法、尼龙膜杂交法以及分 子标记技术法。 关键词：微卫星；分子标记；实验动物 (( 微卫星又称为简单序列重复短串联 Microsatellite),Simple Sequence Repeat, SSR), (〜 重复是以少数几个核甘酸(一般个) 为重复单位的串 Short Tandem Repeat STR),16 ⑴， 联重复序列。微卫星位点广泛分布于真核生物的基因组中 在植物基因组中平 DNA 均每存在一个长的微卫星位点，而在哺乳动 物中每存在一个 33 Kb20 bp6 Kb20 bp 长的微卫星位点⑵。并且的重复次数不同和重 复程度不同，使其呈现高度的多态 SSR 性。微卫星标记共显性的特点使它能够用于研 究等位基因，区分二倍体(或多倍体)的纯 合体或杂合体，这是、等显性标记所无法做到的。另外，微卫星的特异性引 AFLPRAPD 物扩增具有良好的重复性和 保真性，方便各实验室间的交流。目前，微卫星标记已被广 泛应用到基因连锁与 遗传图谱构建、遗传多样性研究、谱系和发育研究、疾病检测以及 品种鉴定、亲 本分析与个体、纯系检验上。 随着微卫星标记在图谱上的丰富，将显现出更大的优势。但微卫星分析中引 物的获 得需要预先获知核酸序列，其广泛应用受限于从特定的物种中分离微卫星 位点的难度 和花费。微卫星标记分离最大的困难是引物的获得。同、等遗传标记不同， RAPDAFLP 微卫星研究首先需要获知位点的序列信息，以便从重复序列两 端侧翼的保守序列中设 计引物。因而微卫星引物的开发是应用该技术的关键。目 前已知微卫星位点的物种很有 限，这是因为微卫星位点的获得需经过克隆、杂交 筛选、测序等步骤，因此需花费一定 的人力、金钱，这限制了微卫星标记的大量