栅藻全转录组测序与类胡萝卜素合成途径相关基因分析

栅藻全转录组测序与类胡萝卜素合成途径相关基因分析引言：栅藻（Chlamydomonas reinhardtii）是一种单细胞的淡水藻类，在全球范围内广泛分布，是一种典型的模式微型生物。栅藻具有许多研究

栅藻全转录组测序与类胡萝卜素合成途径相关基因分 析 引言： 栅藻（Chlamydomonasreinhardtii）是一种单细胞的淡水藻类， 在全球范围内广泛分布，是一种典型的模式微型生物。栅藻具有许多研 究价值，例如，它是氧合成作用中氧气演化的模型生物之一，同时还能 够进行两性生殖和有性生殖，是研究生殖和发育的理想模型生物。除此 之外，栅藻还广泛用于光合作用、光感受性、细胞分裂和转录后调控等 领域的研究。随着测序技术和计算能力的提高，全基因组测序和全转录 组测序已成为研究栅藻生物学的有力工具。 类胡萝卜素合成是栅藻生物学研究的重要方向之一，类胡萝卜素是 一种天然色素，在光合作用中充当重要角色，还具有抗氧化、维生素A 前体、核黄素合成等多种生理活性。类胡萝卜素的生物合成过程包括多 个酶催化的反应，已在许多真菌和植物中得到深入的研究。在栅藻中， 类胡萝卜素的生物合成也吸引了不少研究者的关注。通过全转录组测序 和基因表达谱分析，可找到与类胡萝卜素生物合成途径相关的基因，深 入研究分子机制，有助于进一步了解栅藻的生物学特性和类胡萝卜素功 能。 方法： 通过RNA测序技术获取栅藻全转录组模型，接下来利用基因注释、 差异表达分析等方法找到与类胡萝卜素生物合成途径相关的基因，并进 行相关GO、KEGG功能分析。 结果： 本研究成功构建了栅藻全转录组模型，首先进行基因注释，筛选出 生物合成途径相关的基因，然后进行差异表达分析，找到一批显著差异 表达的基因。接下来进行GO、KEGG功能分析，发现这些基因主要与光