基于三维结构的蛋白质相似性判定方法研究的任务书

基于三维结构的蛋白质相似性判定方法研究的任务书一、任务背景随着生物信息学技术的发展，越来越多的蛋白质序列被解析出来，但是对于许多蛋白质的结构仍然无法通过实验手段得到，因此需要发展计算机模拟方法来预测蛋

基于三维结构的蛋白质相似性判定方法研究的任务书 一、任务背景 随着生物信息学技术的发展，越来越多的蛋白质序列被解析出来， 但是对于许多蛋白质的结构仍然无法通过实验手段得到，因此需要发展 计算机模拟方法来预测蛋白质的结构。在蛋白质结构预测的过程中，相 似性搜索是非常重要的一步，可以根据已知蛋白质结构的信息，找到相 似的蛋白质序列，并利用这些知识来预测其结构。 目前，主要的蛋白质相似性检索方法包括序列比对和结构比对。序 列比对基于蛋白质的氨基酸序列信息，可以找到相似的序列，但是缺乏 与蛋白质的结构信息相关的特定信息，难以对结构不同但序列相似的蛋 白质进行区分。直接利用蛋白质结构信息进行比对可以解决这个问题， 因为蛋白质结构决定了其功能和性质，具有很高的特异性。因此，基于 三维结构的蛋白质相似性检索方法是目前蛋白质结构预测领域的热点之 一。 二、任务目的 本研究的目的是研究并开发一种基于三维结构的蛋白质相似性判定 方法，该方法能够在结构不同但序列相似的蛋白质中进行区分和筛选， 提高蛋白质结构预测的精度。 三、任务内容 1. 收集蛋白质结构和序列数据库以及实验验证数据集。 2. 研究和分析目前流行的基于三维结构的蛋白质相似性检索方法的 原理和优缺点。 3. 提出新的基于三维结构的蛋白质相似性判定算法，并开发相应的 软件系统。 4. 实现该算法在两个蛋白质之间计算其结构相似度的方法，包括结