利用生物信息学研究污水中病毒多样性的中期报告

利用生物信息学研究污水中病毒多样性的中期报告项目背景随着全球人口的增长和城市化的加速，污水处理厂面临着越来越大的挑战，如如何高效处理大量的废水，如何降低处理成本，以及如何减少由无法有效去除的污染物导致

利用生物信息学研究污水中病毒多样性的中期报告 项目背景 随着全球人口的增长和城市化的加速，污水处理厂面临着越来越大 的挑战，如如何高效处理大量的废水，如何降低处理成本，以及如何减 少由无法有效去除的污染物导致的环境和健康问题。病毒是废水中重要 的污染物之一，不仅在人类健康方面有一定的危害性，而且对环境的影 响也越来越受到人们的关注。因此，研究污水中病毒的多样性和分布规 律，对优化污水处理工艺和保护人类健康和环境都具有重要的意义。 项目目标 本项目旨在利用生物信息学技术，分析污水中病毒的多样性和分布 特征，比较不同处理工艺对病毒的去除效果，为污水处理厂提供科学依 据。 项目进展 1.采集污水样品 我们在某市区的三个污水处理厂分别采集生活污水进厂前、进厂后 和出厂水样共计9个样品，用0.22μm滤膜过滤，将滤过的液体存储在 -80°C的冰箱中，为后续实验做准备。 2.提取病毒核酸 我们利用商用核酸提取试剂盒提取了9个样品中的病毒核酸，并用 琼脂糖凝胶电泳和比色法检测了提取的核酸的完整性和纯度。 3.建库测序和数据分析 我们利用IlluminaMiSeq平台对9个样品进行了建库测序，得到了 约50万个原始序列。我们通过过滤、去除低质量序列、去除低频序列、 去除宿主序列等步骤对原始数据进行了预处理和质控，并利用MEGAN6 和UPARSE等软件对数据进行了聚类和物种注释。初步结果表明，这9