基于人类代谢酶网络的冠心病疾病风险模块识别的中期报告

基于人类代谢酶网络的冠心病疾病风险模块识别的中期报告首先，本研究旨在基于人类代谢酶网络来识别冠心病疾病风险模块。目前已完成的工作主要包括以下几个方面：1. 数据预处理我们从GEO数据库中下载了多个冠心

基于人类代谢酶网络的冠心病疾病风险模块识别的中 期报告 首先，本研究旨在基于人类代谢酶网络来识别冠心病疾病风险模 块。目前已完成的工作主要包括以下几个方面： 1.数据预处理 我们从GEO数据库中下载了多个冠心病患者和健康对照组的基因表 达数据，并使用R语言中的limma包进行数据预处理，包括归一化、探 针注释和基因差异表达分析等。 2.代谢酶网络构建 我们采用了人类代谢网络数据库HMDB中的代谢酶信息，通过网络 构建算法构建了一个包含2059个代谢酶节点和33722个代谢通路边的 代谢酶网络。 3.模块识别 我们使用了WGCNA算法来识别冠心病相关的代谢酶模块。具体来 说，我们根据代谢酶网络中各节点在不同基因表达数据中的表达情况， 计算了它们之间的相关性，并将高度相关的节点聚类为一个模块。最 终，我们得到了10个冠心病相关的代谢酶模块。 接下来的工作将集中在以下几个方面： 1.模块功能分析 我们将对所得到的代谢酶模块进行功能注释分析，以进一步确定这 些模块与冠心病之间的生物学联系。 2.模块与基因表达数据的关联分析 我们将进一步将这些代谢酶模块与基因表达数据中的DEGs进行关 联分析，以探究这些模块在冠心病中的潜在功能和作用机制。