Mesquite操作步骤

系统发育分析软件Mesquite对铁线蕨属鞭叶系植物毛被形态性状在分子系统树上进行了重建,揭示铁线蕨属鞭叶系植物毛被主要特征的系统演化规律。背景:用MrBayes v.3.1.2软件构建贝叶斯树, 依

Mesquite 系统发育分析软件对铁线蕨属鞭叶系植物毛被形态性状在分子系统树上进行了 , 重建揭示铁线蕨属鞭叶系植物毛被主要特征的系统演化规律。 MrBayesv.3.1.2,Modeltest3.7AIC 用软件构建贝叶斯树依据中最小值产生的最佳核 背景: TIM+I+G,nst6,rates 苷酸替换模型为设置核苷酸替代类型数=位点间速率分布设置为= gamma,,4100,100, 以随机树为起始树条马尔可夫链运行万代每代抽样并保存数据一次舍弃 2500,.1001001 老化样本(抽样代)后根据剩余样本构建合意树(共得到万除以,再加,共 10001 计棵树。由于对 Mesquite9001 来说,需要舍弃前面贝叶斯计算不稳定的棵树,只保留最后计算 1000Ultraeditg.nex.run1.t 稳定的棵树。这时会用到软件(见群共享),对文件进行编辑只保留最后 ) 1000 棵树 操作步骤如下: 1. File 主菜单 openfileg.nex.run1.tok —(文件类型举例)点后出现界面 Treesfromviewtrees 鼠标点上图“”,后点

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