利用ATAC--seq和RNA--seq技术解析水稻杂种优势的分子机制

利用ATAC--seq和RNA--seq技术解析水稻杂种优势的分子机制标题：利用ATAC-seq和RNA-seq技术解析水稻杂种优势的分子机制摘要：水稻是世界上最重要的粮食作物之一，杂交稻是现代水稻育

ATAC--seqRNA--seq 利用和技术解析水稻杂种优 势的分子机制 ATAC-seqRNA-seq 标题：利用和技术解析水稻杂种优势的分子机 制 摘要： 水稻是世界上最重要的粮食作物之一，杂交稻是现代水稻育种的重 要成果之一。水稻杂交优势是指杂交后获得的杂种在某些性状上具有比 亲本更优的表型特征。这种优势对水稻产量的提高具有重要意义。本研 ATAC-seqRNA-seq 究利用和技术，从表观遗传和转录水平揭示水稻杂 种优势的分子机制。结果显示，开放染色质的动态重塑和基因表达调控 是水稻杂种优势的重要分子机制。 引言： 杂交水稻的产量远高于纯系种植的水稻，这使得杂交育种成为提高 水稻产量的重要途径。然而，水稻杂种优势的分子机制仍然不完全清 ATAC-seqRNA-seq 楚。近年来，高通量的测序技术包括和的发展为揭 ATAC-seq 示水稻杂种优势的分子机制提供了新途径。可以用来测定开放 RNA-seq 染色质区域，而可以用来测量基因的表达水平。 方法： AB 本研究收集了亲本、亲本和杂种水稻的根部样本，并进行了 ATAC-seqRNA-seqATAC-seq 和测序。首先，对数据进行测序质量控制 Bowtie2 和数据过滤，然后利用将测序数据比对到水稻基因组。接下 MACS2 来，使用软件识别开放染色质峰值，并根据亲本和杂种之间的峰 RNA-seqHISAT2 值差异来确定杂种优势区域。对于数据，使用软件将 DESeq2 测序数据比对到水稻转录组。然后，使用软件对基因的表达进行 差异分析。