三维基因组学研究新方法获重要进展

Nature Genetics丨三维基因组学研究新方法获重要进展 4月26日，武汉金开瑞生物工程有限公司技术顾问、华中农业大学教授， 曹罡课题组与华中农业大学李国亮教授课题组在国际著名期刊Natu

NatureGenetics丨三维基因组学研究新方法获重要进展 4月26日，武汉金开瑞生物工程有限公司技术顾问、华中农业大学教授，曹罡课题组 与华中农业大学李国亮教授课题组在国际著名期刊NatureGenetics上联合发表题为 “Digestion-ligation-onlyHi-Cisanefficientandcost-effectivemethodfor chromosomeconformationcapture”的研究论文。该论文主要介绍了一种新的染色体构象 捕获技术（DLOHi-C），为解析基因组三维结构提供了一种新型、高效、经济的研究方法。 基因组三维空间结构与功能的研究简称三维基因组学（Three-Dimensional Genomics,3DGenomics），是指在考虑基因组序列、基因结构及其调控元件的同时，对基因 组序列在细胞核内的三维空间结构，及其在基因转录、调控、复制和修复等生物过程中功能 的研究。染色体是由DNA与组蛋白共同组成，从染色体的一级结构（绳珠模型）到四级超螺 旋折叠结构，DNA分子一共被压缩了8400倍左右，正是这些折叠和压缩，导致基因在细胞中 的分布复杂而又有序，只有了解清楚染色体区域（A/Bcompartments、TADs、Loops），才可 以将基因组上原本分散的远距离调控元件与其具体调控区域更好的关联起来，对理解基因的 转录调控、增强子与启动子的相互作用、疾病易感位点、DNA损伤修复、基因组结构变异和 表观遗传有着重要的意义。 科学家们对染色体三维结构的研究很早就开始了，但是相关的研究一直不够深入，同时 缺乏微观的证据。直到2003年JobDekker及其合作者提出了染色质构象捕获技术 （ChromatinConformationCapture,3C），用于测定特定的点到点之间的染色质交互作用。 随后，科学家们扩展了3C技术，开发了4C技术（CircularizedChromatinConformation Capture），用于测定一点到多点之间的染色质交互作用。Dostie等人接着开发了5C技术 （Carbon-CopyChromatinConformationCapture），用于测定多点到多点之间的染色质交 互作用。