杨树基因组甲基化昼夜节律的MSAP分析的中期报告

杨树基因组甲基化昼夜节律的MSAP分析的中期报告杨树基因组甲基化昼夜节律的MSAP分析中期报告研究背景：甲基化是植物基因组中重要的表观修饰方式之一，参与了基因转录调控、基因组稳定性维持和适应环境变化等

MSAP 杨树基因组甲基化昼夜节律的分析的中期报 告 杨树基因组甲基化昼夜节律的MSAP分析中期报告 研究背景： 甲基化是植物基因组中重要的表观修饰方式之一，参与了基因转录 调控、基因组稳定性维持和适应环境变化等重要功能。近年来，越来越 多的研究表明，植物甲基化具有昼夜节律，即基因组甲基化状态在昼夜 周期内发生变化。而杨树是世界上最重要的造林树种之一，对杨树基因 组甲基化昼夜节律的研究有助于深入了解杨树适应环境的分子机制。 研究目的： 本研究旨在利用MSAP技术，研究杨树基因组甲基化状态的昼夜节 律，探究不同时刻基因组甲基化状态的变化规律，为揭示杨树适应环境 的分子机制提供有力的实验依据。 研究内容： 1.水培实验材料的采集与预处理 本研究采用杨树的原代叶片，经光照13h/暗处11h的处理，定时在 昼夜不同时间点取材。采集叶片后，将其表面的水分吸干，迅速放入液 氮中冷冻保存。 2.MSAP反应体系的建立与量化PCR 将杨树基因组DNA分别酶切，ligation，扩增，PCR产物进行分离 纯化并测序，基于甲基化与非甲基化位点间叶链中的CpG和CHG位点 判断甲基化状态，并利用量化PCR对其进行验证和表征。 3.数据分析与结果呈现