基于内含子和外显子的系统发育分析的比较

基于内含子和外显子的系统发育分析的比较3 陈润生 王 宁( )中国科学院生物物理研究所 ,北京 100101 . 3 联系人 摘要 在灵长目动物中分离出 7 个断裂基因的内含子和外显子序列 ,分别进行

基于内含子和外显子的系统发育分析的比较 3陈润生王宁 ()中国科学院生物物理研究所,北京100101.3联系人 摘要在灵长目动物中分离出7个断裂基因的内含子和外显子序列,分别进行 系统发育分析. ()比较结果显示:1基于内含子与基于外显子所得到的进化树的拓扑结构基 本一致,但由于内 ()含子和外显子序列的突变速率不同,导致进化树的分枝长度不同;2在 hominoids中,外显子 ()的替代速率下降,而内含子的替代速率相对稳定;3当选用cebus作为参 考物种时,基于不同外显子推测出的orangutan的分歧时间相差较大,而基于不 同内含子序列所得的分歧时间比较 ()接近,且与化石记录相吻合,这说明内含子序列可作为一个更好的“分子 钟”;4对于不同基因,序列的G+C含量与它的替代速率有一定关系,当内 含子的替代速率大于相应的外显子时,内含子的G+C含量较低.所有这些结果 显示,内含子序列可以用来在近亲缘关系的物种中进行进化分析. 关键词系统发育分析内含子替代速率分子进化 在研究分子进化时,人们通常根据一些相对保守的序列进行分析,比如rRNA 序列、蛋白质的氨基酸序列、编码蛋白质的核酸序列.这样做的原因一方面是由 于这些保守的序列会带 1来相对可靠的结果;另一方面是由于在数据库中,这些序列可以比较方便地 得到.但基于DNA非编码区序列的分子进化分析还少见报道.