柿EST-SSR标记在柿属植物中的通用性研究

柿ESTSSR标记在柿属植物中的通用性研究 柿EST—SSR标记在柿属植物中的通用性研究简单重复序列（Simple sequence repeats，SSR）分子标记技术通常又称为微卫星标记（Mi

柿EST SSR标记在柿属植物中的通用性研究 柿EST—SSR标记在柿属植物中的通用性研究 简单重复序列（Simplesequencerepeats，SSR）分子标记技术通常又称为微卫星标记 （Microsatellites），它是指以1～6个核苷酸为单位多次串联重复的DNA序列。与其他分 子标记技术相比，SSR标记具有多态性高、共显特性、易用聚合酶链式反应（Polymerase chainreaction，PCR）检测、重复性强、数量丰富和对基因组有很好的覆盖性等特点[1]。根 据SSR的来源可将其分为基因组SSR和表达序列标签（Expressedsequencetag，EST） -SSR。EST是来自随机选取的特定处理的cDNA克隆末端序列，能反映mRNA的信息，在 功能基因组研究中具有重要意义。EST-SSR与基因组SSR标记相比，具有不同物种间通用 性较好、开发方法简单及成本低廉等优点[2]。而且EST-SSR标记来自于基因的编码序列， 更容易获得基因表达的信息，所以现在已成为重要的农作物农艺性状定位、遗传作图、遗传 多样性、比较基因组学研究的新型工具。目前，大麦（HordeumvulgareL.）[3]、小麦 （TriticumaestivumL.）[3]、油菜（BrassicacampestrisL.）[4]、柑橘（Citrusreticulata Blanco）[5]等许多农作物已从公共数据库中成功地开发出了大量的EST-SSR标记。 柿（DiospyroskakiThunb.）是柿科（Ebenaceae）柿属（DiospyrosL.）植物中作为果树 栽培的代表种，其栽培历史已有二千余年。中国是柿属植物的分布中心和原产中心之一，拥 有丰富的种质资源。目前，已利用多种分子标记技术对柿属植物进行了遗传分析，如Du等 [6]在柿上开发了反转座子标记，Guo等[7]利用简单序列重复区间扩增多态性（Inter-simple sequencerepeat，ISSR）技术开发了SSR标记。我们也开发了EST-SSR和靶位区域扩增多 态性（Targetregionamplifiedpolymorphism，TRAP）标记[8，9]，并在柿品种间进行了遗传 分析，但是这些标记对于柿属其他种植物是否能通用尚需进一步试验。本研究利用前期开发 的11个EST-SSR标记对柿属15个种20份试材进行了标记通用性评价，旨在为柿及其近缘 种种质鉴定及遗传多样性分析提供实用、高效的研究工具。