株新的HIV-1CRF01 AECRF07 BC独特重组型毒株的鉴定

个人简历个人简历姓名 李兴广 性别 男民族 汉族 政治面貌 团员籍贯 山东省苍山县 出生日期 1985．12联系电话 1520122625l E—mail lixingguang．0539@1 63．

中 文 摘 要 中文摘要 HIV-1最重要的特征之一是其具有高度的遗传多样性，基因重组在其中扮演 了 十 分 重 要 的 角 色 。 全 球 范 围 内 H I V - 1 流 行 重 组 型 和 独 特 重 组 型 越 来 越 多 ， 并 在 H I V 的 流 行 中 发 挥 着 越 来 越 重 要 的 作 用 。 本 研 究 选 择 了 一 份 来 自 于 吉 林 省 同 性 恋 H I V 感 染 者 的 血 浆 样 本 ， 采 用 近 末 端 稀 释 的 方 法 对 该 样 本 进 行 近 全 长 基 因 组 ( N e a r g e n o m e ， N F L G ) 扩 f u l l ． 1 e n g t h 增，电泳鉴定结果表明成功扩增出9．1kb的近全长基因组片段。获得的阳性PCR 产 物 经 胶 纯 化 后 直 接 进 行 序 列 测 定 ， 获 得 的 序 列 数 据 经 拼 接 和 清 理 后 ， 采 用 5．05软件进行系统进化树分析，SimPlot3．5．1软件进行重组断点分析， MEGA 7 ． 0 ． 9 ． 0 软 件 进 行 序 列 比 对 分 析 。 B i o E d i t 重 组 断 点 分 析 结 果 显 示 ， 该 序 列 由 C R F 0 1 B C 重 组 形 成 ， A E 和 C R F 0 7 要 骨 架 为 C R F 0 1 A E ， 序 列 中 包 括 4 个 重 组 断 点 ， 相 对 于 H X B 2 分 别 位 于 主 4 4 3 4 7 3 9 b p ， 5 5 0 1 b p 和 5 8 2 5 b p ， 2 个 C R F 0 7 B C 片 段 存 在 于 p o l 基 因 l b p ， 和 v i f - v p r 基 因 区 段 ， 长 度 分 别 为 3 4 0 b p 和 3 2 3 b p 。 系 统 进 化 树 分 析 结 果 显 示 ， 该 病 毒 中 的 3 个 C R F 0 1 A E 片 段 均 与 来 源 于 我 国 北 方 主 要 在 M S M 人 群 中 流 行 的 C R F 0 1 A E 毒 株 聚 集 在 一 起 ， 其 B o o t s t r a p 值 为 1 0 0 ％ ， 这 一 结 果 提 示 C R F 0 1 A E 的 亲 本 可 能 来 源 于 M S M 人 群 ， 在 M S M 人 群 中 可 能 比 较 容 易 发 生 基 因 重 组 。 该 病 毒 中 的 2 个 非 C R F 0 1 A E 片 段 与 B C 参 考 毒 株 集 聚 在 一 起 ， B o o t s t r a p 值 分 别 为 7 7 ％ 和 9 9 ％ 。 序 列 比 对 C R F 0 7 果 显 示 ， 2 个 片 段 的 核 苷 酸 序 列 均 与 C R F 0 7 B C 参 考 株 一 致 ， 这 表 明 2 个 片 结 段 均 来 源 于 C R F 0 7 B C 毒 株 。 本 研 究 获 得 的 H I V - 1 新 的 重 组 模 式 病 毒 主 要 骨 架 为 C R F 0 1 A E ， 常 规 的 利 用 g a g 和 e n v 基 因 鉴 定 H I V 亚 型 的 方 法 无 法 准 确 定 义 ， 这 表 明 我 国 H I V 的 流 行 可能比预期复杂，HIV分子流行病学研究中对于亚型的鉴定将面临新的挑战。 关键词：人类免疫缺陷病毒1型，近全长基因组，独特重组型，CRF01—AE， C R F 0 7 B C ， 重 组 断 点 分 析 ， 系 统 发 生 分 析