基于猪60K芯片数据鉴别藏猪的高原适应性选择信号

基于猪60K芯片数据鉴别藏猪的高原适应性选择信号近年来，随着城市化和工业化的发展，农业生产规模逐渐扩大，畜牧业也不例外。然而，畜牧业在生产过程中面临诸多问题，其中之一就是生态环境的变化。例如，在高原地

60K 基于猪芯片数据鉴别藏猪的高原适应性选择信 号 近年来，随着城市化和工业化的发展，农业生产规模逐渐扩大，畜 牧业也不例外。然而，畜牧业在生产过程中面临诸多问题，其中之一就 是生态环境的变化。例如，在高原地区，氧气稀薄、气温较低等气候因 素对于生长在这个环境中的畜牧动物来说是非常具有挑战性的。 藏猪作为一种抗逆能力较强的高原重要家畜，长期时间内经受了高 原恶劣环境的磨练，以其高度的适应性和优良的肉质在养殖业界广受欢 迎。然而，因为少量的藏猪品种右沟繁殖基础以及长期的自然选择，高 原适应性的信号亦供业界探讨和开发。 60K 为了深入了解藏猪适应高原环境的生物基础，我们采用了猪芯 片数据的测序技术进行数据鉴别。鉴别分别从基因变异、基因表达端、 表观遗传、基因组学等层面进行。本次研究发现，以下几个基因和适应 高原环境有着紧密的联系。 HBBbeta 首先，基因，该基因编码血红蛋白链，这是一种在血液中 运输氧气的关键蛋白质。当躯体缺氧时，血红蛋白的含氧量会降低，影 HBB 响细胞的正常代谢，而藏猪基因单核苷酸变异接近满频，这是一种 自然选择的结果，也是藏猪在高原环境下适应能力的表现。 NIT2 其次，基因在肌肉细胞中的表达量与寿命、体重的关系密切相 关，对肌红蛋白的合成有着重要作用。而在藏猪中，该基因的路径途径 20kb 在区域上有诸多的共同变异，表明该基因与藏猪的肌肉生长发育密 切相关，藏猪在恶劣环境中能够保持强壮的状态也与这个基因有密切关 联。 此外，表观遗传学研究还发现，藏猪在高原生存条件中通过对部分 POU5F1UHRF1 基因的甲基化和乙酰化来调节基因表达水平。在基因和 基因中，研究发现，藏猪在垂直高度变化和光照条件下存在着不同的甲